Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MRTO4Q9UKD2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRTO4Q9UKD2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRTO4Q9UKD2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRTO4Q9UKD2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRTO4Q9UKD2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms