Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FBXO3Q9UK99 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FBXO3Q9UK99 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FBXO3Q9UK99 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FBXO3Q9UK99 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FBXO3Q9UK99 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FBXO3Q9UK99 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FBXO3Q9UK99 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FBXO3Q9UK99 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FBXO3Q9UK99 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FBXO3Q9UK99 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FBXO3Q9UK99 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
FBXO3Q9UK99 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FBXO3Q9UK99 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
FBXO3Q9UK99 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FBXO3Q9UK99 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
FBXO3Q9UK99 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FBXO3Q9UK99 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FBXO3Q9UK99 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FBXO3Q9UK99 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FBXO3Q9UK99 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FBXO3Q9UK99 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FBXO3Q9UK99 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FBXO3Q9UK99 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FBXO3Q9UK99 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FBXO3Q9UK99 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FBXO3Q9UK99 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
FBXO3Q9UK99 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FBXO3Q9UK99 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
FBXO3Q9UK99 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FBXO3Q9UK99 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FBXO3Q9UK99 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FBXO3Q9UK99 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FBXO3Q9UK99 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FBXO3Q9UK99 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FBXO3Q9UK99 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FBXO3Q9UK99 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FBXO3Q9UK99 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
FBXO3Q9UK99 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FBXO3Q9UK99 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FBXO3Q9UK99 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FBXO3Q9UK99 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FBXO3Q9UK99 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FBXO3Q9UK99 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
FBXO3Q9UK99 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FBXO3Q9UK99 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
FBXO3Q9UK99 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
FBXO3Q9UK99 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
FBXO3Q9UK99 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FBXO3Q9UK99 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FBXO3Q9UK99 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FBXO3Q9UK99 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
FBXO3Q9UK99 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms