Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCN11AQ9UI33 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCN11AQ9UI33 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCN11AQ9UI33 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCN11AQ9UI33 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCN11AQ9UI33 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
SCN11AQ9UI33 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCN11AQ9UI33 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCN11AQ9UI33 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCN11AQ9UI33 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCN11AQ9UI33 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCN11AQ9UI33 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SCN11AQ9UI33 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCN11AQ9UI33 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCN11AQ9UI33 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCN11AQ9UI33 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCN11AQ9UI33 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCN11AQ9UI33 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCN11AQ9UI33 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCN11AQ9UI33 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCN11AQ9UI33 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCN11AQ9UI33 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCN11AQ9UI33 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCN11AQ9UI33 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCN11AQ9UI33 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCN11AQ9UI33 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCN11AQ9UI33 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCN11AQ9UI33 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCN11AQ9UI33 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCN11AQ9UI33 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCN11AQ9UI33 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
SCN11AQ9UI33 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SCN11AQ9UI33 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SCN11AQ9UI33 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SCN11AQ9UI33 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCN11AQ9UI33 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCN11AQ9UI33 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCN11AQ9UI33 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCN11AQ9UI33 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SCN11AQ9UI33 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SCN11AQ9UI33 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SCN11AQ9UI33 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SCN11AQ9UI33 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SCN11AQ9UI33 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SCN11AQ9UI33 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SCN11AQ9UI33 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SCN11AQ9UI33 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SCN11AQ9UI33 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SCN11AQ9UI33 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SCN11AQ9UI33 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SCN11AQ9UI33 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SCN11AQ9UI33 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCN11AQ9UI33 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCN11AQ9UI33 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SCN11AQ9UI33 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCN11AQ9UI33 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SCN11AQ9UI33 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SCN11AQ9UI33 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.89
SCN11AQ9UI33 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SCN11AQ9UI33 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SCN11AQ9UI33 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SCN11AQ9UI33 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SCN11AQ9UI33 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SCN11AQ9UI33 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SCN11AQ9UI33 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SCN11AQ9UI33 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SCN11AQ9UI33 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SCN11AQ9UI33 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms