Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms