Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNAL1Q9UBT7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNAL1Q9UBT7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNAL1Q9UBT7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNAL1Q9UBT7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNAL1Q9UBT7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTNNAL1Q9UBT7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNNAL1Q9UBT7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTNNAL1Q9UBT7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNAL1Q9UBT7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNAL1Q9UBT7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNAL1Q9UBT7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNAL1Q9UBT7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTNNAL1Q9UBT7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNAL1Q9UBT7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNNAL1Q9UBT7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNAL1Q9UBT7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNAL1Q9UBT7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNAL1Q9UBT7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNAL1Q9UBT7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNAL1Q9UBT7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNAL1Q9UBT7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNAL1Q9UBT7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNAL1Q9UBT7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNAL1Q9UBT7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNAL1Q9UBT7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNAL1Q9UBT7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNAL1Q9UBT7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNAL1Q9UBT7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNAL1Q9UBT7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNAL1Q9UBT7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNAL1Q9UBT7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNAL1Q9UBT7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNAL1Q9UBT7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNAL1Q9UBT7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNAL1Q9UBT7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNAL1Q9UBT7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNAL1Q9UBT7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNAL1Q9UBT7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms