Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS3

DNAJB9, DnaJ homolog subfamily B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB9Q9UBS3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJB9Q9UBS3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJB9Q9UBS3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJB9Q9UBS3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJB9Q9UBS3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJB9Q9UBS3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJB9Q9UBS3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJB9Q9UBS3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJB9Q9UBS3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJB9Q9UBS3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJB9Q9UBS3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJB9Q9UBS3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJB9Q9UBS3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAJB9Q9UBS3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJB9Q9UBS3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJB9Q9UBS3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJB9Q9UBS3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJB9Q9UBS3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJB9Q9UBS3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJB9Q9UBS3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJB9Q9UBS3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJB9Q9UBS3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJB9Q9UBS3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJB9Q9UBS3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms