Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF10DQ9UBN6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF10DQ9UBN6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF10DQ9UBN6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF10DQ9UBN6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF10DQ9UBN6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF10DQ9UBN6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF10DQ9UBN6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF10DQ9UBN6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF10DQ9UBN6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF10DQ9UBN6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF10DQ9UBN6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF10DQ9UBN6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF10DQ9UBN6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF10DQ9UBN6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF10DQ9UBN6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF10DQ9UBN6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF10DQ9UBN6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF10DQ9UBN6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF10DQ9UBN6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF10DQ9UBN6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms