Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBJ2

ABCD2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD2Q9UBJ2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCD2Q9UBJ2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ABCD2Q9UBJ2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCD2Q9UBJ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCD2Q9UBJ2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms