Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2AFY2Q9P0M6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFY2Q9P0M6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFY2Q9P0M6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFY2Q9P0M6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFY2Q9P0M6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFY2Q9P0M6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFY2Q9P0M6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFY2Q9P0M6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFY2Q9P0M6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFY2Q9P0M6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFY2Q9P0M6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms