Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXC10Q9NYD6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HOXC10Q9NYD6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXC10Q9NYD6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXC10Q9NYD6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXC10Q9NYD6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXC10Q9NYD6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXC10Q9NYD6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXC10Q9NYD6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXC10Q9NYD6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXC10Q9NYD6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXC10Q9NYD6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXC10Q9NYD6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXC10Q9NYD6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXC10Q9NYD6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXC10Q9NYD6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HOXC10Q9NYD6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HOXC10Q9NYD6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXC10Q9NYD6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXC10Q9NYD6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXC10Q9NYD6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXC10Q9NYD6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXC10Q9NYD6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXC10Q9NYD6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXC10Q9NYD6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXC10Q9NYD6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXC10Q9NYD6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXC10Q9NYD6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXC10Q9NYD6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXC10Q9NYD6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXC10Q9NYD6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXC10Q9NYD6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXC10Q9NYD6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXC10Q9NYD6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXC10Q9NYD6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXC10Q9NYD6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXC10Q9NYD6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXC10Q9NYD6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXC10Q9NYD6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOXC10Q9NYD6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXC10Q9NYD6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXC10Q9NYD6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXC10Q9NYD6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXC10Q9NYD6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXC10Q9NYD6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXC10Q9NYD6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXC10Q9NYD6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXC10Q9NYD6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXC10Q9NYD6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXC10Q9NYD6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXC10Q9NYD6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms