Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL6

SIDT1, SID1 transmembrane family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIDT1Q9NXL6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIDT1Q9NXL6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIDT1Q9NXL6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SIDT1Q9NXL6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIDT1Q9NXL6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIDT1Q9NXL6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIDT1Q9NXL6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SIDT1Q9NXL6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms