Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM140Q9NV12 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM140Q9NV12 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM140Q9NV12 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms