Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXD4L1Q9NU39 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
FOXD4L1Q9NU39 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXD4L1Q9NU39 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXD4L1Q9NU39 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXD4L1Q9NU39 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXD4L1Q9NU39 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXD4L1Q9NU39 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXD4L1Q9NU39 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXD4L1Q9NU39 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXD4L1Q9NU39 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXD4L1Q9NU39 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXD4L1Q9NU39 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXD4L1Q9NU39 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXD4L1Q9NU39 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXD4L1Q9NU39 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD4L1Q9NU39 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXD4L1Q9NU39 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXD4L1Q9NU39 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXD4L1Q9NU39 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXD4L1Q9NU39 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXD4L1Q9NU39 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXD4L1Q9NU39 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXD4L1Q9NU39 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXD4L1Q9NU39 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXD4L1Q9NU39 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXD4L1Q9NU39 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXD4L1Q9NU39 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXD4L1Q9NU39 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXD4L1Q9NU39 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXD4L1Q9NU39 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXD4L1Q9NU39 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXD4L1Q9NU39 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXD4L1Q9NU39 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FOXD4L1Q9NU39 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FOXD4L1Q9NU39 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
FOXD4L1Q9NU39 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXD4L1Q9NU39 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXD4L1Q9NU39 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXD4L1Q9NU39 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXD4L1Q9NU39 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXD4L1Q9NU39 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
FOXD4L1Q9NU39 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FOXD4L1Q9NU39 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.5 ms