Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EMILIN3Q9NT22 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EMILIN3Q9NT22 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EMILIN3Q9NT22 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EMILIN3Q9NT22 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EMILIN3Q9NT22 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EMILIN3Q9NT22 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EMILIN3Q9NT22 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
EMILIN3Q9NT22 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EMILIN3Q9NT22 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
EMILIN3Q9NT22 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EMILIN3Q9NT22 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EMILIN3Q9NT22 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EMILIN3Q9NT22 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EMILIN3Q9NT22 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EMILIN3Q9NT22 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EMILIN3Q9NT22 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EMILIN3Q9NT22 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EMILIN3Q9NT22 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EMILIN3Q9NT22 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EMILIN3Q9NT22 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EMILIN3Q9NT22 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EMILIN3Q9NT22 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EMILIN3Q9NT22 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EMILIN3Q9NT22 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EMILIN3Q9NT22 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EMILIN3Q9NT22 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EMILIN3Q9NT22 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EMILIN3Q9NT22 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EMILIN3Q9NT22 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms