Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTNNBIP1Q9NSA3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms