Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC22A11Q9NSA0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A11Q9NSA0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC22A11Q9NSA0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC22A11Q9NSA0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms