Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TULP4Q9NRJ4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TULP4Q9NRJ4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
TULP4Q9NRJ4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TULP4Q9NRJ4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TULP4Q9NRJ4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TULP4Q9NRJ4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TULP4Q9NRJ4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TULP4Q9NRJ4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TULP4Q9NRJ4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TULP4Q9NRJ4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TULP4Q9NRJ4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TULP4Q9NRJ4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TULP4Q9NRJ4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TULP4Q9NRJ4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TULP4Q9NRJ4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TULP4Q9NRJ4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TULP4Q9NRJ4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TULP4Q9NRJ4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TULP4Q9NRJ4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TULP4Q9NRJ4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TULP4Q9NRJ4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TULP4Q9NRJ4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TULP4Q9NRJ4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
TULP4Q9NRJ4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TULP4Q9NRJ4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TULP4Q9NRJ4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TULP4Q9NRJ4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TULP4Q9NRJ4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TULP4Q9NRJ4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TULP4Q9NRJ4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
TULP4Q9NRJ4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
TULP4Q9NRJ4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TULP4Q9NRJ4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TULP4Q9NRJ4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TULP4Q9NRJ4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TULP4Q9NRJ4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TULP4Q9NRJ4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TULP4Q9NRJ4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TULP4Q9NRJ4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TULP4Q9NRJ4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TULP4Q9NRJ4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TULP4Q9NRJ4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
TULP4Q9NRJ4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
TULP4Q9NRJ4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
TULP4Q9NRJ4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TULP4Q9NRJ4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
TULP4Q9NRJ4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TULP4Q9NRJ4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TULP4Q9NRJ4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TULP4Q9NRJ4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TULP4Q9NRJ4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TULP4Q9NRJ4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TULP4Q9NRJ4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TULP4Q9NRJ4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TULP4Q9NRJ4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TULP4Q9NRJ4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TULP4Q9NRJ4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TULP4Q9NRJ4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TULP4Q9NRJ4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TULP4Q9NRJ4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TULP4Q9NRJ4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TULP4Q9NRJ4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TULP4Q9NRJ4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TULP4Q9NRJ4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TULP4Q9NRJ4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TULP4Q9NRJ4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.26
TULP4Q9NRJ4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TULP4Q9NRJ4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
TULP4Q9NRJ4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TULP4Q9NRJ4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TULP4Q9NRJ4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TULP4Q9NRJ4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TULP4Q9NRJ4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms