Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLE4Q9NR33 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLE4Q9NR33 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLE4Q9NR33 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms