Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRDM10Q9NQV6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM10Q9NQV6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM10Q9NQV6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM10Q9NQV6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM10Q9NQV6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM10Q9NQV6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM10Q9NQV6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM10Q9NQV6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM10Q9NQV6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRDM10Q9NQV6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRDM10Q9NQV6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRDM10Q9NQV6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PRDM10Q9NQV6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM10Q9NQV6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRDM10Q9NQV6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRDM10Q9NQV6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRDM10Q9NQV6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRDM10Q9NQV6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PRDM10Q9NQV6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRDM10Q9NQV6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRDM10Q9NQV6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM10Q9NQV6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRDM10Q9NQV6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRDM10Q9NQV6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRDM10Q9NQV6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PRDM10Q9NQV6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM10Q9NQV6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM10Q9NQV6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM10Q9NQV6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM10Q9NQV6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM10Q9NQV6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM10Q9NQV6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM10Q9NQV6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM10Q9NQV6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM10Q9NQV6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM10Q9NQV6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM10Q9NQV6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM10Q9NQV6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM10Q9NQV6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRDM10Q9NQV6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM10Q9NQV6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PRDM10Q9NQV6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRDM10Q9NQV6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRDM10Q9NQV6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms