Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQE9

HINT3, Histidine triad nucleotide-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINT3Q9NQE9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HINT3Q9NQE9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HINT3Q9NQE9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HINT3Q9NQE9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HINT3Q9NQE9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HINT3Q9NQE9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms