Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX9Q9NQ69 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX9Q9NQ69 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LHX9Q9NQ69 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms