Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IL1RAPQ9NPH3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IL1RAPQ9NPH3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IL1RAPQ9NPH3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IL1RAPQ9NPH3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IL1RAPQ9NPH3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IL1RAPQ9NPH3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IL1RAPQ9NPH3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IL1RAPQ9NPH3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IL1RAPQ9NPH3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IL1RAPQ9NPH3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IL1RAPQ9NPH3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IL1RAPQ9NPH3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IL1RAPQ9NPH3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IL1RAPQ9NPH3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IL1RAPQ9NPH3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms