Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIX2Q9NPC8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIX2Q9NPC8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIX2Q9NPC8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SIX2Q9NPC8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SIX2Q9NPC8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SIX2Q9NPC8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SIX2Q9NPC8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIX2Q9NPC8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIX2Q9NPC8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIX2Q9NPC8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIX2Q9NPC8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIX2Q9NPC8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIX2Q9NPC8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIX2Q9NPC8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIX2Q9NPC8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIX2Q9NPC8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIX2Q9NPC8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIX2Q9NPC8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIX2Q9NPC8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIX2Q9NPC8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIX2Q9NPC8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIX2Q9NPC8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIX2Q9NPC8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIX2Q9NPC8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SIX2Q9NPC8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIX2Q9NPC8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms