Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
KCNK9Q9NPC2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNK9Q9NPC2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNK9Q9NPC2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNK9Q9NPC2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNK9Q9NPC2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNK9Q9NPC2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNK9Q9NPC2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNK9Q9NPC2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNK9Q9NPC2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNK9Q9NPC2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNK9Q9NPC2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNK9Q9NPC2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNK9Q9NPC2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNK9Q9NPC2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNK9Q9NPC2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNK9Q9NPC2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNK9Q9NPC2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNK9Q9NPC2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNK9Q9NPC2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNK9Q9NPC2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNK9Q9NPC2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNK9Q9NPC2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNK9Q9NPC2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms