Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VTA1Q9NP79 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VTA1Q9NP79 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VTA1Q9NP79 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VTA1Q9NP79 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VTA1Q9NP79 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VTA1Q9NP79 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VTA1Q9NP79 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VTA1Q9NP79 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VTA1Q9NP79 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VTA1Q9NP79 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
VTA1Q9NP79 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VTA1Q9NP79 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VTA1Q9NP79 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VTA1Q9NP79 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VTA1Q9NP79 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VTA1Q9NP79 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VTA1Q9NP79 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VTA1Q9NP79 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VTA1Q9NP79 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VTA1Q9NP79 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VTA1Q9NP79 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
VTA1Q9NP79 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VTA1Q9NP79 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VTA1Q9NP79 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VTA1Q9NP79 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VTA1Q9NP79 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
VTA1Q9NP79 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VTA1Q9NP79 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VTA1Q9NP79 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
VTA1Q9NP79 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VTA1Q9NP79 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VTA1Q9NP79 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VTA1Q9NP79 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
VTA1Q9NP79 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VTA1Q9NP79 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VTA1Q9NP79 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VTA1Q9NP79 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VTA1Q9NP79 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VTA1Q9NP79 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
VTA1Q9NP79 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VTA1Q9NP79 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VTA1Q9NP79 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VTA1Q9NP79 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VTA1Q9NP79 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VTA1Q9NP79 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VTA1Q9NP79 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VTA1Q9NP79 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VTA1Q9NP79 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VTA1Q9NP79 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms