Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMURF1Q9HCE7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMURF1Q9HCE7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMURF1Q9HCE7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms