Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAH1

ZNF556, Zinc finger protein 556, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF556Q9HAH1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF556Q9HAH1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF556Q9HAH1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF556Q9HAH1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF556Q9HAH1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms