Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4K1

RIBC2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIBC2Q9H4K1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIBC2Q9H4K1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIBC2Q9H4K1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIBC2Q9H4K1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIBC2Q9H4K1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIBC2Q9H4K1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIBC2Q9H4K1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIBC2Q9H4K1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIBC2Q9H4K1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIBC2Q9H4K1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIBC2Q9H4K1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIBC2Q9H4K1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIBC2Q9H4K1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIBC2Q9H4K1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIBC2Q9H4K1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIBC2Q9H4K1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIBC2Q9H4K1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIBC2Q9H4K1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms