Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNMDQ9H2S6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
TNMDQ9H2S6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TNMDQ9H2S6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNMDQ9H2S6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNMDQ9H2S6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNMDQ9H2S6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TNMDQ9H2S6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNMDQ9H2S6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TNMDQ9H2S6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNMDQ9H2S6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNMDQ9H2S6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNMDQ9H2S6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNMDQ9H2S6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNMDQ9H2S6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNMDQ9H2S6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNMDQ9H2S6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNMDQ9H2S6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNMDQ9H2S6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNMDQ9H2S6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNMDQ9H2S6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TNMDQ9H2S6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNMDQ9H2S6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TNMDQ9H2S6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNMDQ9H2S6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNMDQ9H2S6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNMDQ9H2S6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNMDQ9H2S6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNMDQ9H2S6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNMDQ9H2S6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TNMDQ9H2S6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNMDQ9H2S6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNMDQ9H2S6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNMDQ9H2S6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNMDQ9H2S6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNMDQ9H2S6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNMDQ9H2S6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNMDQ9H2S6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNMDQ9H2S6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNMDQ9H2S6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNMDQ9H2S6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNMDQ9H2S6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNMDQ9H2S6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNMDQ9H2S6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNMDQ9H2S6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNMDQ9H2S6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNMDQ9H2S6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNMDQ9H2S6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNMDQ9H2S6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNMDQ9H2S6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNMDQ9H2S6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNMDQ9H2S6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNMDQ9H2S6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNMDQ9H2S6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNMDQ9H2S6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNMDQ9H2S6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNMDQ9H2S6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNMDQ9H2S6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNMDQ9H2S6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNMDQ9H2S6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TNMDQ9H2S6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNMDQ9H2S6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNMDQ9H2S6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNMDQ9H2S6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNMDQ9H2S6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNMDQ9H2S6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNMDQ9H2S6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNMDQ9H2S6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TNMDQ9H2S6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNMDQ9H2S6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNMDQ9H2S6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNMDQ9H2S6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNMDQ9H2S6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNMDQ9H2S6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms