Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NSD3Q9BZ95 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NSD3Q9BZ95 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NSD3Q9BZ95 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NSD3Q9BZ95 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NSD3Q9BZ95 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NSD3Q9BZ95 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NSD3Q9BZ95 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
NSD3Q9BZ95 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NSD3Q9BZ95 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NSD3Q9BZ95 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NSD3Q9BZ95 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NSD3Q9BZ95 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NSD3Q9BZ95 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NSD3Q9BZ95 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
NSD3Q9BZ95 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NSD3Q9BZ95 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NSD3Q9BZ95 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NSD3Q9BZ95 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NSD3Q9BZ95 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NSD3Q9BZ95 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NSD3Q9BZ95 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
NSD3Q9BZ95 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
NSD3Q9BZ95 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NSD3Q9BZ95 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NSD3Q9BZ95 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NSD3Q9BZ95 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NSD3Q9BZ95 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NSD3Q9BZ95 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NSD3Q9BZ95 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NSD3Q9BZ95 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NSD3Q9BZ95 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NSD3Q9BZ95 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NSD3Q9BZ95 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NSD3Q9BZ95 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
NSD3Q9BZ95 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NSD3Q9BZ95 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NSD3Q9BZ95 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NSD3Q9BZ95 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NSD3Q9BZ95 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NSD3Q9BZ95 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NSD3Q9BZ95 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NSD3Q9BZ95 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NSD3Q9BZ95 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NSD3Q9BZ95 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NSD3Q9BZ95 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NSD3Q9BZ95 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NSD3Q9BZ95 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NSD3Q9BZ95 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NSD3Q9BZ95 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NSD3Q9BZ95 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NSD3Q9BZ95 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NSD3Q9BZ95 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NSD3Q9BZ95 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NSD3Q9BZ95 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
NSD3Q9BZ95 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NSD3Q9BZ95 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NSD3Q9BZ95 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NSD3Q9BZ95 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NSD3Q9BZ95 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NSD3Q9BZ95 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NSD3Q9BZ95 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NSD3Q9BZ95 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
NSD3Q9BZ95 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NSD3Q9BZ95 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NSD3Q9BZ95 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NSD3Q9BZ95 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NSD3Q9BZ95 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NSD3Q9BZ95 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NSD3Q9BZ95 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NSD3Q9BZ95 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NSD3Q9BZ95 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NSD3Q9BZ95 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NSD3Q9BZ95 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NSD3Q9BZ95 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.4 ms