Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPL1Q9BYD6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL1Q9BYD6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL1Q9BYD6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms