Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REPIN1Q9BWE0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REPIN1Q9BWE0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
REPIN1Q9BWE0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
REPIN1Q9BWE0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms