Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP58Q9BVL2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP58Q9BVL2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP58Q9BVL2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP58Q9BVL2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP58Q9BVL2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP58Q9BVL2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP58Q9BVL2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP58Q9BVL2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP58Q9BVL2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUP58Q9BVL2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP58Q9BVL2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms