Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS4Q9BT78 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS4Q9BT78 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS4Q9BT78 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms