Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSTN3Q9BQT9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSTN3Q9BQT9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSTN3Q9BQT9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSTN3Q9BQT9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSTN3Q9BQT9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSTN3Q9BQT9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSTN3Q9BQT9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSTN3Q9BQT9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLSTN3Q9BQT9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSTN3Q9BQT9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSTN3Q9BQT9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSTN3Q9BQT9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSTN3Q9BQT9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CLSTN3Q9BQT9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSTN3Q9BQT9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSTN3Q9BQT9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSTN3Q9BQT9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLSTN3Q9BQT9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSTN3Q9BQT9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSTN3Q9BQT9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSTN3Q9BQT9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSTN3Q9BQT9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSTN3Q9BQT9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSTN3Q9BQT9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSTN3Q9BQT9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSTN3Q9BQT9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSTN3Q9BQT9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSTN3Q9BQT9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSTN3Q9BQT9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSTN3Q9BQT9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSTN3Q9BQT9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSTN3Q9BQT9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSTN3Q9BQT9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSTN3Q9BQT9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSTN3Q9BQT9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSTN3Q9BQT9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSTN3Q9BQT9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSTN3Q9BQT9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSTN3Q9BQT9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSTN3Q9BQT9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSTN3Q9BQT9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSTN3Q9BQT9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSTN3Q9BQT9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLSTN3Q9BQT9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CLSTN3Q9BQT9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLSTN3Q9BQT9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLSTN3Q9BQT9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLSTN3Q9BQT9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLSTN3Q9BQT9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLSTN3Q9BQT9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSTN3Q9BQT9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSTN3Q9BQT9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSTN3Q9BQT9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSTN3Q9BQT9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSTN3Q9BQT9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSTN3Q9BQT9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSTN3Q9BQT9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSTN3Q9BQT9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLSTN3Q9BQT9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSTN3Q9BQT9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSTN3Q9BQT9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSTN3Q9BQT9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSTN3Q9BQT9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSTN3Q9BQT9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSTN3Q9BQT9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSTN3Q9BQT9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSTN3Q9BQT9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSTN3Q9BQT9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSTN3Q9BQT9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSTN3Q9BQT9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSTN3Q9BQT9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSTN3Q9BQT9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN3Q9BQT9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN3Q9BQT9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN3Q9BQT9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN3Q9BQT9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSTN3Q9BQT9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSTN3Q9BQT9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSTN3Q9BQT9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms