Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLX1AQ9BQ83 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLX1AQ9BQ83 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLX1AQ9BQ83 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLX1AQ9BQ83 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLX1AQ9BQ83 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms