Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TREX2Q9BQ50 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TREX2Q9BQ50 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TREX2Q9BQ50 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms