Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3GL2Q99962 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3GL2Q99962 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3GL2Q99962 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3GL2Q99962 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3GL2Q99962 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3GL2Q99962 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3GL2Q99962 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3GL2Q99962 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3GL2Q99962 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3GL2Q99962 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3GL2Q99962 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3GL2Q99962 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3GL2Q99962 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3GL2Q99962 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3GL2Q99962 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3GL2Q99962 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3GL2Q99962 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3GL2Q99962 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3GL2Q99962 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3GL2Q99962 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3GL2Q99962 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3GL2Q99962 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3GL2Q99962 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3GL2Q99962 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3GL2Q99962 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3GL2Q99962 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3GL2Q99962 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3GL2Q99962 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3GL2Q99962 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms