Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYSTQ99698 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms