Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOTCH4Q99466 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOTCH4Q99466 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOTCH4Q99466 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NOTCH4Q99466 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOTCH4Q99466 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOTCH4Q99466 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NOTCH4Q99466 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOTCH4Q99466 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOTCH4Q99466 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOTCH4Q99466 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOTCH4Q99466 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOTCH4Q99466 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NOTCH4Q99466 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NOTCH4Q99466 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NOTCH4Q99466 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NOTCH4Q99466 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOTCH4Q99466 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOTCH4Q99466 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOTCH4Q99466 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOTCH4Q99466 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOTCH4Q99466 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NOTCH4Q99466 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOTCH4Q99466 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOTCH4Q99466 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOTCH4Q99466 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOTCH4Q99466 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOTCH4Q99466 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOTCH4Q99466 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOTCH4Q99466 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOTCH4Q99466 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOTCH4Q99466 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOTCH4Q99466 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOTCH4Q99466 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOTCH4Q99466 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOTCH4Q99466 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOTCH4Q99466 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOTCH4Q99466 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOTCH4Q99466 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOTCH4Q99466 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOTCH4Q99466 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOTCH4Q99466 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NOTCH4Q99466 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOTCH4Q99466 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOTCH4Q99466 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOTCH4Q99466 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOTCH4Q99466 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NOTCH4Q99466 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOTCH4Q99466 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms