Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHOX2BQ99453 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHOX2BQ99453 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHOX2BQ99453 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHOX2BQ99453 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHOX2BQ99453 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PHOX2BQ99453 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHOX2BQ99453 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PHOX2BQ99453 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PHOX2BQ99453 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHOX2BQ99453 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHOX2BQ99453 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHOX2BQ99453 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHOX2BQ99453 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHOX2BQ99453 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHOX2BQ99453 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHOX2BQ99453 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHOX2BQ99453 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHOX2BQ99453 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHOX2BQ99453 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHOX2BQ99453 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHOX2BQ99453 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms