Protein–RNA interactions for Protein: Q96T54

KCNK17, Potassium channel subfamily K member 17, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK17Q96T54 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNK17Q96T54 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNK17Q96T54 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNK17Q96T54 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK17Q96T54 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNK17Q96T54 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNK17Q96T54 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK17Q96T54 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK17Q96T54 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK17Q96T54 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK17Q96T54 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK17Q96T54 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK17Q96T54 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK17Q96T54 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK17Q96T54 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK17Q96T54 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK17Q96T54 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK17Q96T54 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK17Q96T54 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK17Q96T54 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms