Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM209Q96SK2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM209Q96SK2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM209Q96SK2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM209Q96SK2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM209Q96SK2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM209Q96SK2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM209Q96SK2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM209Q96SK2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM209Q96SK2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM209Q96SK2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM209Q96SK2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM209Q96SK2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM209Q96SK2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM209Q96SK2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM209Q96SK2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM209Q96SK2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM209Q96SK2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM209Q96SK2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM209Q96SK2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM209Q96SK2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMEM209Q96SK2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM209Q96SK2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms