Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF3Q96PU9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ODF3Q96PU9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF3Q96PU9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms