Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms