Protein–RNA interactions for Protein: Q96N58

ZNF578, Zinc finger protein 578, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF578Q96N58 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF578Q96N58 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF578Q96N58 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF578Q96N58 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF578Q96N58 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF578Q96N58 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF578Q96N58 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF578Q96N58 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF578Q96N58 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF578Q96N58 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms