Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI9

CXorf58, Putative uncharacterized protein CXorf58, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf58Q96LI9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXorf58Q96LI9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXorf58Q96LI9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXorf58Q96LI9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXorf58Q96LI9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXorf58Q96LI9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXorf58Q96LI9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXorf58Q96LI9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXorf58Q96LI9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXorf58Q96LI9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXorf58Q96LI9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXorf58Q96LI9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CXorf58Q96LI9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXorf58Q96LI9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXorf58Q96LI9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXorf58Q96LI9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXorf58Q96LI9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CXorf58Q96LI9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXorf58Q96LI9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CXorf58Q96LI9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CXorf58Q96LI9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXorf58Q96LI9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXorf58Q96LI9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXorf58Q96LI9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXorf58Q96LI9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXorf58Q96LI9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXorf58Q96LI9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXorf58Q96LI9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXorf58Q96LI9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXorf58Q96LI9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXorf58Q96LI9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXorf58Q96LI9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CXorf58Q96LI9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXorf58Q96LI9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXorf58Q96LI9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXorf58Q96LI9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXorf58Q96LI9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXorf58Q96LI9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXorf58Q96LI9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXorf58Q96LI9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms