Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP3Q96LB9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGLYRP3Q96LB9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGLYRP3Q96LB9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms