Protein–RNA interactions for Protein: Q96J84

KIRREL1, Kin of IRRE-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL1Q96J84 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIRREL1Q96J84 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KIRREL1Q96J84 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KIRREL1Q96J84 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIRREL1Q96J84 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIRREL1Q96J84 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIRREL1Q96J84 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIRREL1Q96J84 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIRREL1Q96J84 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIRREL1Q96J84 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIRREL1Q96J84 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIRREL1Q96J84 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KIRREL1Q96J84 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIRREL1Q96J84 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms