Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A3Q96HJ5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A3Q96HJ5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms